各学院研究生分会是校研究生会的基层组织，承认并遵守《昆明理工大学研究生会章程》。

校研究生会下设23个研究生分会，各研究生分会设主席1名，副主席1-2名，办公室主任1名（其他部门设置根据各分会情况而定，上报校研究生会备案）。

呈贡校区（17个分会）：

机电工程学院研究生分会

电力工程学院研究生分会

信息工程与自动化学院研究生分会

建筑工程学院研究生分会

环境科学与工程学院研究生分会

化学工程学院研究生分会

生命科学与技术学院研究生分会

交通工程学院研究生分会

现代农业工程学院研究生分会

法学院研究生分会

马克思主义学院研究生分会

艺术与传媒学院研究生分会

理学院研究生分会

医学院研究生分会

云南省食品安全研究院研究生分会

建筑与城市规划学院研究生分会

外国语言文化学院研究生分会

莲华校区（6个分会）：

国土资源工程学院研究生分会

冶金与能源工程学院研究生分会

材料科学与工程学院研究生分会

管理与经济学院研究生分会

知识产权发展研究院研究生分会

质量发展研究院研究生分会